生物信息学(第2版)(配增值)
¥108.00定价
作者: 李霞,雷健波
出版时间:2015-05-27
出版社:人民卫生出版社
- 人民卫生出版社
- 9787117204538
- 117294
- 41234012-7
- 大16开
- 2015-05-27
- 525
- 理学
- 生物学
- Q811.4
- 临床医学
- 本科(长学制)
目录
绪论
第一节 生物信息学的兴起
第二节 生物信息学的内涵及其在生命科学中的应用
一、生物信息学的内涵
二、生物信息学在现代生物医学中的应用
第三节 大数据时代的生物信息学与医学
一、人类基因组计划
二、组学与生物信息学
三、大数据时代的生物信息学与医学
第一篇 生物信息学基础
第一章 生物序列资源
第一节 引言
第二节 NCBI数据库与数据资源
一、NCBI序列数据库概述
二、NCBI中的重要子库介绍
第三节 UCSC基因组浏览器与数据资源
一、UCSC概述
二、UCSC基因组浏览器
三、UCSC中的数据资源和常用工具
第四节 EMBL-EBI数据库与数据资源
一、EMBL-EBI数据库概况
二、EMBL基因组和核酸序列资源
三、UniProt蛋白质数据资源
四、Biomart数据检索平台
第五节 重要的非编码基因数据库
一、ENCODE数据库与数据资源
二、microRNA数据资源miRBase
小结
第二章 序列比对
第一节 引言
一、同源、相似与距离
二、相似与距离的定量描述
三、算法实现的比对
四、序列比对的作用
第二节 比对算法概要
一、替换计分矩阵
二、双序列全局比对
三、双序列局部比对
四、多序列全局比对
五、多序列局部比对
六、比对的统计显著性
第三节 数据库搜索
一、经典BLAST
二、衍生BLAST
三、BLAT
四、RNA序列搜索
五、数据库搜索的统计显著性
第四节 比对软件、参数与数据资源
一、参数选择的一般原则
二、主要比对软件
三、EBI中的序列比对工具
四、UCSC中的BLAT比对工具
第五节 比对技术的发展
—、glocal比对
二、全基因组比对
小结
……
第三章 序列特征分析
第四章 分子进化分析
第五章 基因表达数据分析
第二篇 功能基因组信息学
第六章 蛋白质组与蛋白质结构分析
第七章 基因注释与功能分类
第八章 转录调控的信息学分析
第九章 生物分子网络与通路
第十章 计算表观遗传学
第三篇 生物信息学与人类复杂疾病
第十一章 复杂疾病的分子特征与计算分析
第十二章 非编码RNA与复杂疾病
第十三章 新一代测序技术与复杂疾病
第十四章 药物生物信息学
第十五章 生物信息学相关学科进展
中英文名词对照索引
英中文名词对照索引
致谢
第一节 生物信息学的兴起
第二节 生物信息学的内涵及其在生命科学中的应用
一、生物信息学的内涵
二、生物信息学在现代生物医学中的应用
第三节 大数据时代的生物信息学与医学
一、人类基因组计划
二、组学与生物信息学
三、大数据时代的生物信息学与医学
第一篇 生物信息学基础
第一章 生物序列资源
第一节 引言
第二节 NCBI数据库与数据资源
一、NCBI序列数据库概述
二、NCBI中的重要子库介绍
第三节 UCSC基因组浏览器与数据资源
一、UCSC概述
二、UCSC基因组浏览器
三、UCSC中的数据资源和常用工具
第四节 EMBL-EBI数据库与数据资源
一、EMBL-EBI数据库概况
二、EMBL基因组和核酸序列资源
三、UniProt蛋白质数据资源
四、Biomart数据检索平台
第五节 重要的非编码基因数据库
一、ENCODE数据库与数据资源
二、microRNA数据资源miRBase
小结
第二章 序列比对
第一节 引言
一、同源、相似与距离
二、相似与距离的定量描述
三、算法实现的比对
四、序列比对的作用
第二节 比对算法概要
一、替换计分矩阵
二、双序列全局比对
三、双序列局部比对
四、多序列全局比对
五、多序列局部比对
六、比对的统计显著性
第三节 数据库搜索
一、经典BLAST
二、衍生BLAST
三、BLAT
四、RNA序列搜索
五、数据库搜索的统计显著性
第四节 比对软件、参数与数据资源
一、参数选择的一般原则
二、主要比对软件
三、EBI中的序列比对工具
四、UCSC中的BLAT比对工具
第五节 比对技术的发展
—、glocal比对
二、全基因组比对
小结
……
第三章 序列特征分析
第四章 分子进化分析
第五章 基因表达数据分析
第二篇 功能基因组信息学
第六章 蛋白质组与蛋白质结构分析
第七章 基因注释与功能分类
第八章 转录调控的信息学分析
第九章 生物分子网络与通路
第十章 计算表观遗传学
第三篇 生物信息学与人类复杂疾病
第十一章 复杂疾病的分子特征与计算分析
第十二章 非编码RNA与复杂疾病
第十三章 新一代测序技术与复杂疾病
第十四章 药物生物信息学
第十五章 生物信息学相关学科进展
中英文名词对照索引
英中文名词对照索引
致谢