1 导言：走进发育的分子分析
  新的思路
  问题的起始
  描述性胚胎学的全盛时期
  实验胚胎学的诞生
  Morgan的“背离”：遗传学
  僵局
  遗传学和分子生物学的接轨
  历史的教训？
  关于本书
 2 DNA和RNA中的程序和调控元件
  发育过程中的DNA
  DNA序列的类型
  基因和基因组
  DNA中的调控序列
  DNA序列的不可逆修饰
  RNA中的调控区域
  基因表达的协调
  发育程序
  高级程序
 3 解码程式：转录
  原核生物基因转录
  真核生物转录装置
  增强子和基囚特异转录因子
  转录因子的DNA结合特异性
  增强子上复合物的装配：增强体
  启动子和增强子之间的相互作用
  染色质在基因转录中的作用
  转录活性和染色质重构的动力学分析
  真核细胞的转录抑制
  转录装置与转录调控
  发育过程中的转录调控：果蝇囊胚从区域划分到条带建立的转变
  发育过程中的转录调控：免疫球蛋白●重链基因的转录调控
  转录的延伸和终止
  转录活性与非活性状态的稳定性
  RNA结合蛋白
  果蝇发育中的RNA定位和发育体制的建立
 4 细胞表面蛋白：受体、配体及其环境
  细胞间的通讯：细胞信号
  信号分子及受体的鉴别
  对信号分子和受体的定性
  信号分子类型
  小分子信号分子
  肽和蛋白质信号分子
  受体
  细胞表面受体
  受体酪氨酸激酶
  丝氨酸／苏氨酸激酶受体
  磷酸酶受体
  胞质激酶相关受体
  具有7次跨膜结构域的受体
  其他细胞表面受体
  作为受体的信号蛋白
  胞内受体
  受体-配体相互作用的调节
  作为信号调制器策源地的脊椎动物组织者
  胞外环境与细胞信息
 5 细胞相互作用的胞内效应：信号转导通路与网络
  上位性与信号转导通路分析
  信号的流通媒介
  接头模体
  一种检测分子间相互作用的工具
  蛋白激酶和磷酸酶的模块
  G蛋白和细胞内的开关
  信号转导通路
  驱动效应器核定位的信号路线
  Delta-Notch信号转导通路
  NFKB/dorsal信号转导通路
  JAK-STAT信号转导通路
  转化生长因子β-Smad信号转导通路
  膜-核传递：MAPK信号级联
  第二信使信号转导通路
  cAMP和PKA
  脂类第二信使途径
  Hedgehog和Wnt信号转导
  Hedgehog信号转导
  Wnt信号转导
  细胞相互作用中信号转导的调控及其动力学特征
  改变信号转导通路组分的活性
  改变信号转导通路组分的浓度和稳定性
  信号的区室化
  信号转导通路的整合
  信号网络的连接和整合
  信号在细胞核中的整合
 6 细胞及细胞间的相互作用
  胞外基质
  细胞骨架
  中间丝
  微管
  肌动蛋白纤维
  细胞粘连和细胞连接
  细胞黏着的媒介分子
  细胞粘连与信号转导
  细胞极性
  顶-基极性
  平面极性
  细胞的形态、运动和迁移
  细胞运动的线索
 7 细胞的基本生命程序：分裂、分化和死亡
  细胞周期
  细胞周期调控因子
  细胞周期工作机制
  细胞周期检验点：整合与监控
  早期发育过程中的细胞周期
  细胞分裂和细胞生长的相互协调
  与细胞生长和细胞增殖联系的细胞外调控
  细胞周期与细胞分化
  细胞死亡：一种终级“分化”
  细胞死亡机制
  发育中的死亡信号
  发育中细胞生存的调控
  细胞数目与总体积
 8 谱系的形成：发育程序的常规展现
  细胞谱系和细胞间相互作用
  谱系和命运图
  干细胞谱系
  干细胞因子
  类干细胞谱系
  复合确定性谱系
  水蛭
  秀丽隐杆线虫
  谱系内的细胞命运决定
  酿酒酵母和秀丽隐杆线虫谱系属性决定子的分隔机制
  神经系统发育过程中谱系属性决定子的分隔机制
  Notch信号转导：谱系介导细胞命运分派中的一种常用手段
  Notch信号转导的时空调控
  细胞命运分派过程中重复的分子机制
  不确定谱系和多克隆谱系的区室
 9 细胞多样性发生中的长程诱导和短程诱导
  诱导与位置信息
  长程和短程诱导分子
  细胞对诱导信号的应答：感受态
  诱导事件的信号诱导修饰
  形态发生素的概念：对可扩散信号的应答分级
  备选形态发生素
  果蝇中的备选形态发生素
  bicoid
  dorsal
  dpp
  脊椎动物中的备选形态发生素
  经典形态发生素概念的局限性
  梯度分子信息的建立
  对梯度分子信息的解读
  图式形成过程中的长程与短程模式机制
 10 细胞类型的特化：发育的操作
  基因时空表达活性的分析方法
  肌肉的发育：肌发生
  肌细胞的起源
  不同中胚层命运的建立
  生肌调控因子与生肌路线的确定
  肌肉分化
  神经发生：中枢神经系统
  中枢神经系统的起源
  神经组织的出现
  神经系统的轴向组织
  神经发育路径的定型
  神经元的诞生：神经元类型的特化
  果蝇的神经发生
  细胞命运建立的调控序位
 11 一维与二维发育模式
  秀丽隐杆线虫产卵器的发育和图式形成
  产卵器前体细胞的产生与特化
  来自锚状细胞的信号：Ras信号通路与VPC的特化
  VPC;lin-12信号
  VPC命运的实施
  产卵器的形态发生
  果蝇幼虫表皮的发育和图式形成
  发育参照和极性的建立
  细胞多样性形成和相互协同
  发育图式的出现
  牙齿的发育和图式形成
  牙齿发育的启动
  形态发生与分化
  牙齿的不同类型
  细胞二维图式构建的普遍原理
 12 三维发育模式
  肢体与附肢
  脊椎动物肢体发育的起始
  肢芽AP轴和DV轴的协同建立
  昆虫附肢的发育起始
  脊椎动物肢体发育的细胞学参数
  由AER推动的PD轴图式形成与生长的起始
  肢芽生长过程与定位信息的分子载体
  ZPA与AER信息的整合
  背-腹轴在肢体图式形成中的作用
  近-远端轴的生长和图式形成
  由Hox编制与确定的位置信息
  趾的发育
  果蝇附肢的发育和图式形成
  翅发育的起始
  翅的图式建立和生长
  翅的发育图式：翅脉
  脊椎动物肢体和果蝇附肢的发育和图式构建策略
  分支结构：昆虫的气管系统与脊椎动物的肺
  果蝇的气管系统
  气管系统中细胞类型的特化
  气管系统分支结构的形态发生
  分支迁移中细胞的特化
  脊椎动物肺的发育
  三维图式形成有没有普适原则？
 英汉名词对照
 索引